指挥官、灵魂人物吴工亮、熊廷弼相继重伤不省人事，整个部队立时就陷入了绝望境地。
就这样，明军还是撑到中午，中华军第七旅全数开入城中，沿着城墙向金川‘门’、玄武‘门’进攻，同时也加强了神策‘门’一带攻击火力。
明军终于撑不住了。浙江兵首先逃跑，连带着南京守备军也崩溃了，金川‘门’、玄武‘门’、钟阜‘门’在中华军第七旅的攻击下，相继落入中华军之手。
到了午后，全城明军崩溃了，南京城出乎意料地被中华军攻破了。
实际上，从尹峰开始直到中华军的普通士兵，全都没有想到大明朝的留都居然就这样自我崩溃了。
万历四十五年的九月底，由于主要将领、指挥官重伤不能视事，守城明军在半天内全体崩溃，毫无能力组织抵抗。因此，大明朝留都南京城陷，**海寇攻入城中。