生活环境不同可分为内阿米巴和自由生活阿米巴，前者寄生于人和动物，主要有4个属；后者生活在水和泥土中，偶尔侵入动物机体，主要有5个属。
人在江河湖塘中游泳或用疫水洗鼻时，含纳格里阿米巴进入鼻腔，增殖后穿过鼻粘膜和筛状板，沿嗅神经上行入脑，侵入中枢神经系统（CNS），引起原发性阿米巴脑膜脑炎（PAM）。原发性阿米巴脑膜脑炎发病急骤，病情发展迅速。开始有头痛、发热、呕吐等症状，迅速转入谵妄、瘫痪、昏迷，最快可在一周内死亡。
【首先要明确，耐格里变形虫进入脑中的唯一机会就是通过鼻腔，喝下遭病原体污染的水并不会被感染。其次，这种病感染的几率极低，无需过度恐慌。最后，才是必要的防护措施：不要在在温暖、未经消毒处理的的河水、湖水、池塘水和温泉水中游泳、洗澡、洗脸，如必须，游泳或参与其他水上体育活动时要保持头部在水面之上或带上鼻夹，并注意避免扰动湖泊或池塘的沉积层，因为里面可能生存着大量的阿米巴原虫。一旦在游泳后出现头痛、呕吐、嗅觉异常、发热等可疑症状，要立即就医。】