，元至正七年（1347年）和明正统十二年（1447年）两度重修。整座寺庙座北朝南，共有五进院落，布局整齐严谨。
柏林寺是因为寺里种着很多古柏而得名，除此以外，还有古槐、古银杏、白皮松等等，枝繁叶茂，郁郁葱葱。寺里的娑罗树也堪称奇物，相传这种树随佛而生，所结的果实，内包着核一百零八粒，正好用来做佛珠。据说北京有这种树的地方只有三处，一处在香山寺前，一处在卧佛寺内，城里唯一的一处就在柏林寺。
不过柏林寺现在虽然对外开放，大殿却终日紧闭，寺里两侧供僧人们修持的禅堂，也都已经变成各家文化公司的办公场所了。